Набор для генотипирования мышей
Кат. номер: HCR2021A
Этот продукт представляет собой набор, предназначенный для быстрой идентификации генотипов мышей, включая неочищенную экстракцию ДНК и систему ПЦР-амплификации.Продукт можно использовать для ПЦР-амплификации непосредственно из хвоста, уха, пальца ноги и других тканей мыши после простого расщепления лизисным буфером и протеиназой k.Никакого ночного расщепления, фенол-хлороформной экстракции или очистки на колонке, что просто и сокращает время экспериментов.Продукт подходит для амплификации целевых фрагментов размером до 2 КБ и мультиплексных ПЦР-реакций с использованием до 3 пар праймеров.Смесь для прямой ПЦР с 2×мышиными тканями содержит генно-инженерную ДНК-полимеразу, Mg.2+, dNTP и оптимизированную буферную систему для обеспечения высокой эффективности амплификации и устойчивости к ингибиторам, так что реакции ПЦР можно проводить путем добавления матрицы и праймеров и регидратации продукта до 1×.Продукт ПЦР, амплифицированный с помощью этого продукта, имеет заметное основание «А» на 3'-конце и может быть использован непосредственно для клонирования ТА после очистки.
Компоненты
Компонент | Размер |
2×смесь для прямой ПЦР тканей мыши | 5×1,0 мл |
Лизисный буфер | 2×20 мл |
Протеиназа К | 800 мкл |
Условия хранения
Продукты следует хранить при температуре -25~-15℃ в течение 2 лет.После оттаивания Lysis Buffer можно хранить при температуре 2–8 ℃ для кратковременного многократного использования и хорошо перемешивать при использовании.
Приложение
Этот продукт подходит для анализа нокаута мышей, обнаружения трансгенов, генотипирования и так далее.
Функции
1.Простое управление: нет необходимости извлекать геномную ДНК;
2.Широкое применение: подходит для прямой амплификации различных тканей мыши.
инструкции
1.Выпуск геномной ДНК
1) Приготовление лизата
Лизат тканей готовят в соответствии с количеством образцов мышей, подлежащих лизису (лизат тканей следует готовить на месте в соответствии с дозировкой и тщательно перемешивать для использования), а пропорция реагентов, необходимая для одного образца, следующая:
Компоненты | Объем (мкл) |
Протеиназа К | 4 |
Лизисный буфер | 200 |
2) Подготовка проб и лизис
Рекомендуемое использование ткани
ТипСалфетка | Рекомендуемый объем |
Мышиный хвост | 1-3 мм |
Мышиное ухо | 2-5 мм |
Мышиный палец | 1-2 шт. |
Возьмите необходимое количество образцов тканей мыши в чистые центрифужные пробирки, добавьте 200 мкл свежего лизата ткани в каждую центрифужную пробирку, перемешайте и встряхните, затем инкубируйте при 55 ℃ в течение 30 минут, а затем нагревайте при 98 ℃ в течение 3 минут.
3) Центрифугирование
Хорошо встряхните лизат и центрифугируйте при 12 000 об/мин в течение 5 минут.Супернатант можно использовать в качестве матрицы для ПЦР-амплификации.Если шаблон необходим для хранения, перенесите надосадочную жидкость в другую стерильную центрифужную пробирку и храните при -20 ℃ в течение 2 недель.
2.ПЦР-амплификация
Достаньте смесь 2×Mouse Tissue Direct PCR Mix из -20 ℃ и разморозьте на льду, перемешайте и подготовьте реакционную систему для ПЦР в соответствии со следующей таблицей (работайте на льду):
Компоненты | 25мклСистема | 50мклСистема | Окончательная концентрация |
2×смесь для прямой ПЦР тканей мыши | 12,5 мкл | 25 мкл | 1× |
Праймер 1 (10 мкм) | 1,0 мкл | 2,0 мкл | 0,4 мкм |
Праймер 2 (10 мкм) | 1,0 мкл | 2,0 мкл | 0,4 мкм |
Продукт расщепленияa | По мере необходимости | По мере необходимости |
|
ддх2O | До 25 мкл | До 50 мкл |
|
Примечание:
а) Добавляемое количество не должно превышать 1/10 от количества системы, а если добавить слишком много, ПЦР-амплификация может быть ингибирована.
Рекомендуемые условия ПЦР
Шаг цикла | Темп. | Время | Циклы |
Начальная денатурация | 94℃ | 5 минут | 1 |
Денатурация | 94℃ | 30 секунд | 35-40 |
Отжигa | Тм+3~5℃ | 30 секунд | |
Расширение | 72℃ | 30 сек/кб | |
Окончательное продление | 72℃ | 5 минут | 1 |
- | 4℃ | Держать | - |
Примечание:
а) Температура отжига: в зависимости от значения Tm праймера рекомендуется устанавливать температуру отжига на меньшее значение Tm праймера +3~5℃.
Распространенные проблемы и решения
1.Никаких целевых полосок
1) Избыточный продукт лизиса.Выберите наиболее подходящее количество шаблона, обычно не более 1/10 системы;
2) Слишком большой размер выборки.Разбавьте лизат в 10 раз, а затем амплифицируйте или уменьшите размер образца и повторите анализ;
3) Образцы тканей несвежие.Рекомендуется использовать свежие образцы тканей;
4) Плохое качество грунтовки.Используйте геномную ДНК для амплификации, чтобы проверить качество праймера и оптимизировать его конструкцию.
2.Неспецифическая амплификация
1) Температура отжига слишком низкая, а количество циклов слишком велико.Увеличить температуру отжига и уменьшить количество циклов;
2) Концентрация шаблона слишком высока.Уменьшите количество шаблона или разбавьте шаблон в 10 раз после амплификации;
3) Плохая специфичность праймера.Оптимизируйте конструкцию праймера.
Примечания
1.Чтобы избежать перекрестного загрязнения между образцами, следует подготовить несколько инструментов для отбора проб, а поверхность инструментов можно очистить 2% раствором гипохлорита натрия или очистителем нуклеиновых кислот после каждого отбора проб, если требуется повторное использование.
2.Рекомендуется использовать свежие ткани мыши, а объем выборки не должен быть слишком большим, чтобы не повлиять на результаты амплификации.
3.Лизисный буфер следует избегать частого замораживания и оттаивания, его можно хранить при температуре 2–8 ℃ для кратковременного многократного использования.При хранении при низкой температуре может выпадать осадок, и его необходимо полностью растворить перед использованием.
4.Смесь для ПЦР следует избегать частого замораживания и оттаивания, ее можно хранить при температуре 4 ℃ для кратковременного повторного использования.
5.Этот продукт предназначен только для научных экспериментальных исследований и не должен использоваться для клинической диагностики или лечения.